Doddi, Andrea
(2025)
Analisi delle proprietà passive di membrana ottenute tramite registrazioni in patch-clamp per la modellizzazione di una cellula di glioblastoma.
[Laurea], Università di Bologna, Corso di Studio in
Fisica [L-DM270], Documento ad accesso riservato.
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Abstract
La linea cellulare T98G è stata sviluppata a partire da una biopsia di tessuto cerebrale prelevata da un uomo caucasico affetto da glioblastoma multiforme. Le T98G, rispetto alle cellule gliali sane il cui potenziale di membrana a riposo (Resting Membrane Potential; RMP) Vrest è circa -80 a -90 mV, sono caratterizzate da valori di Vrest di circa -20/-40 mV, associati ad una maggiore corrente K+ rettificante verso l’esterno. Il RMP, insieme alla capacità di input (Cm) e alla resistenza di input (RI), rappresenta una delle proprietà passive della membrana plasmatica particolarmente rilevanti nello studio di cellule non eccitabili, come le T98G. Le scarse evidenze di letteratura riguardo alla modellizzazione in silico di cellule non eccitabili hanno contribuito a fornire il razionale di questo lavoro di tesi. Attraverso l’impiego del Software NEURON si è quindi modellizzata una cellula T98G attraverso l’analisi delle proprietà passive di membrana, estrapolate sperimentalmente tramite registrazioni elettrofisiologiche di patch-clamp in current-clamp (4 cellule). Grazie al supporto di un algoritmo di ottimizzazione globale stocastica, si sono ottenute inoltre le proprietà attive della membrana, in qualità di conduttanze ioniche dei canali implementati nel modello (BNaC, K2P, gBk, KCa3.1, ClC-2, ClC-3 e TRPC6). La simulazione del protocollo sperimentale eseguito per la cellula 4 ha restituito i valori di potenziale di membrana per ciascuno step di corrente, che confrontati con i valori sperimentali non evidenziano una differenza statisticamente significativa (p. value = 0,2464). La versione finale del modello prevede l’utilizzo dei valori medi di ciascuna proprietà passiva considerando tutte e 4 le cellule registrate (Vrest: -11,4 ± 4 mV; Cm calcolata: 48,1 ± 7,7 pF; RI: 411,7 ± 108,7 MΩ; τ: 19,2 ± 4,8 ms), al fine di ottenere uno strumento di supporto utile per simulare gli esiti della sperimentazione elettrofisiologica con un buon grado di predittività.
Abstract
La linea cellulare T98G è stata sviluppata a partire da una biopsia di tessuto cerebrale prelevata da un uomo caucasico affetto da glioblastoma multiforme. Le T98G, rispetto alle cellule gliali sane il cui potenziale di membrana a riposo (Resting Membrane Potential; RMP) Vrest è circa -80 a -90 mV, sono caratterizzate da valori di Vrest di circa -20/-40 mV, associati ad una maggiore corrente K+ rettificante verso l’esterno. Il RMP, insieme alla capacità di input (Cm) e alla resistenza di input (RI), rappresenta una delle proprietà passive della membrana plasmatica particolarmente rilevanti nello studio di cellule non eccitabili, come le T98G. Le scarse evidenze di letteratura riguardo alla modellizzazione in silico di cellule non eccitabili hanno contribuito a fornire il razionale di questo lavoro di tesi. Attraverso l’impiego del Software NEURON si è quindi modellizzata una cellula T98G attraverso l’analisi delle proprietà passive di membrana, estrapolate sperimentalmente tramite registrazioni elettrofisiologiche di patch-clamp in current-clamp (4 cellule). Grazie al supporto di un algoritmo di ottimizzazione globale stocastica, si sono ottenute inoltre le proprietà attive della membrana, in qualità di conduttanze ioniche dei canali implementati nel modello (BNaC, K2P, gBk, KCa3.1, ClC-2, ClC-3 e TRPC6). La simulazione del protocollo sperimentale eseguito per la cellula 4 ha restituito i valori di potenziale di membrana per ciascuno step di corrente, che confrontati con i valori sperimentali non evidenziano una differenza statisticamente significativa (p. value = 0,2464). La versione finale del modello prevede l’utilizzo dei valori medi di ciascuna proprietà passiva considerando tutte e 4 le cellule registrate (Vrest: -11,4 ± 4 mV; Cm calcolata: 48,1 ± 7,7 pF; RI: 411,7 ± 108,7 MΩ; τ: 19,2 ± 4,8 ms), al fine di ottenere uno strumento di supporto utile per simulare gli esiti della sperimentazione elettrofisiologica con un buon grado di predittività.
Tipologia del documento
Tesi di laurea
(Laurea)
Autore della tesi
Doddi, Andrea
Relatore della tesi
Correlatore della tesi
Scuola
Corso di studio
Ordinamento Cds
DM270
Parole chiave
modello,patch-clamp,proprietà passive della membrana cellulare,glioblastoma
Data di discussione della Tesi
12 Dicembre 2025
URI
Altri metadati
Tipologia del documento
Tesi di laurea
(NON SPECIFICATO)
Autore della tesi
Doddi, Andrea
Relatore della tesi
Correlatore della tesi
Scuola
Corso di studio
Ordinamento Cds
DM270
Parole chiave
modello,patch-clamp,proprietà passive della membrana cellulare,glioblastoma
Data di discussione della Tesi
12 Dicembre 2025
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