DS4H Image Alignment tool: algoritmi per allineamento automatico con estensione dei tool competitor e possibilità di correzioni elastiche includendo gestione ottimizzata di immagini multicanale

Molti degli studi sul cancro iniziano con l'analisi di campioni istologici, cioè campioni di tessuto prelevati dal paziente. Attraverso l'uso di marcatori specifici, ovvero coloranti selettivi applicati alla sezione da analizzare, vengono studiate parti specifiche del campione ed ottenute più informazioni dal campione stesso. Tuttavia, questi marcatori non possono sempre essere applicati contemporaneamente e spesso vengono utilizzati in sequenza dopo un lavaggio del campione. Per poter condurre studi di colocalizzazione, le immagini ottenute devono quindi essere allineate simulando l'acquisizione parallela dei diversi segnali. Purtroppo, non esiste una procedura standard per l'allineamento di queste immagini e l'allineamento manuale richiede tempo ed è soggetto a possibili errori. L'utilizzo di un software potrebbe rendere il processo più rapido e affidabile. In particolare, DS4H Image Alignment è un plug-in open-source, user-friendly implementato per ImageJ/Fiji che permette di allineare immagini multimodali con una richiesta di minima iterazione da parte dell’utente.