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Abstract
Il più delle volte, l’analisi approfondita di un campione biologico richiede l’acquisizione di immagini in differenti momenti, utilizzando differenti modalità e/o colorazioni. Le informazioni acquisite forniscono dati funzionali e morfologici, ma per sfruttare realmente tutta la conoscenza, le immagini acquisite devono essere co-registrate per poter poi procedere con analisi di co-localizzazione. In pratica, secondo il principio aristotelico “Il tutto è maggiore della somma delle sue parti”, la registrazione multimodale dell’immagine è un compito impegnativo che porta a fondere insieme segnali complementari. Negli ultimi anni, sono stati descritti diversi metodi per la registrazione delle immagini, ma sfortunatamente non esiste un singolo metodo che funziona per tutte le applicazioni. Inoltre, oggi non esiste uno strumento intuitivo per l’allineamento delle immagini che non richieda importanti competenze informatiche da parte dell’utente. In questo lavoro, oltre a revisionare tutte le soluzioni disponibili gratuitamente per la co-registrazione di immagini di microscopia, descriviamo DS4H Image Alignment, un plug-in open source sviluppato per Fiji per l’allineamento di immagini 2D multimodali, di immunoistochimica e/o di immunofluorescenza, progettato con l’obiettivo di essere estremamente facile da utilizzare.
Abstract
Il più delle volte, l’analisi approfondita di un campione biologico richiede l’acquisizione di immagini in differenti momenti, utilizzando differenti modalità e/o colorazioni. Le informazioni acquisite forniscono dati funzionali e morfologici, ma per sfruttare realmente tutta la conoscenza, le immagini acquisite devono essere co-registrate per poter poi procedere con analisi di co-localizzazione. In pratica, secondo il principio aristotelico “Il tutto è maggiore della somma delle sue parti”, la registrazione multimodale dell’immagine è un compito impegnativo che porta a fondere insieme segnali complementari. Negli ultimi anni, sono stati descritti diversi metodi per la registrazione delle immagini, ma sfortunatamente non esiste un singolo metodo che funziona per tutte le applicazioni. Inoltre, oggi non esiste uno strumento intuitivo per l’allineamento delle immagini che non richieda importanti competenze informatiche da parte dell’utente. In questo lavoro, oltre a revisionare tutte le soluzioni disponibili gratuitamente per la co-registrazione di immagini di microscopia, descriviamo DS4H Image Alignment, un plug-in open source sviluppato per Fiji per l’allineamento di immagini 2D multimodali, di immunoistochimica e/o di immunofluorescenza, progettato con l’obiettivo di essere estremamente facile da utilizzare.
Tipologia del documento
Tesi di laurea
(Laurea)
Autore della tesi
Duma, Marco Edoardo
Relatore della tesi
Correlatore della tesi
Scuola
Corso di studio
Indirizzo
Curriculum ingegneria informatica
Ordinamento Cds
DM270
Parole chiave
istologia,microscopia,immunoistochimica sequenziale,Allineamento multi-modale,Fiji Plugin
Data di discussione della Tesi
27 Maggio 2022
URI
Altri metadati
Tipologia del documento
Tesi di laurea
(NON SPECIFICATO)
Autore della tesi
Duma, Marco Edoardo
Relatore della tesi
Correlatore della tesi
Scuola
Corso di studio
Indirizzo
Curriculum ingegneria informatica
Ordinamento Cds
DM270
Parole chiave
istologia,microscopia,immunoistochimica sequenziale,Allineamento multi-modale,Fiji Plugin
Data di discussione della Tesi
27 Maggio 2022
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