Progetto e sviluppo di un software per l'esecuzione del workflow analitico su immagini e dati generati da una piattaforma di analisi cellulare

La medicina di precisione rappresenta ad oggi la più promettente alternativa alla somministrazione di farmaci Trial & Error ed è il principio fondante di CellPly, azienda del settore delle biotecnologie che ricerca e sviluppa soluzioni per la terapia personalizzata del cancro. L’azienda utilizza diverse tecnologie per l’acquisizione di immagini di cellule sottoposte a vari trattamenti sotto studio, a supporto delle quali risulta essenziale un adeguato software di analisi degli esperimenti. Questo lavoro di tesi si è focalizzato sull’analisi approfondita del programma attualmente in uso e delle sue criticità, sfociando poi nel progetto e nella realizzazione di un nuovo software di analisi. Il progetto è stato diviso in Sprint secondo la metodologia SCRUM e, dopo una fase di studio delle principali best practice UX/UI è stata avviata la raccolta dei requisiti. Da qui, seguendo le fasi del ciclo di vita del software, sono state svolte tutte le attività di analisi e progettazione necessarie allo sviluppo vero e proprio. Infine, il software risultante è stato distribuito, testato e valutato. Le principali feature del nuovo software possono essere riassunte come segue: l’utente può visualizzare e manipolare immagini acquisite dallo strumento caricandole sia da file system sia da database. L’utente può, inoltre, lanciare diversi algoritmi automatici di detection delle cellule presenti nelle immagini, ottenendo come risultato diversi file di output contenenti i dati delle cellule trovate nella fase di detection. A supporto dell’intero progetto sono stati utilizzati svariati strumenti, tra cui GIT come sistema di versionamento, Eclipse come IDE e JavaFX come linguaggio di programmazione ad oggetti. La versione del software attualmente distribuita e in uso dall’azienda non è che il trampolino di lancio di un progetto molto più ampio e innovativo in cui verrà inclusa, in primis, anche una parte di classificazione manuale/semi-automatica delle cellule.