Implementazione in linguaggio C++ in versione ottimizzata del tool Reconstruction and Visualization from a Single Projection (ReViSP)

Belloni, Sofia (2021) Implementazione in linguaggio C++ in versione ottimizzata del tool Reconstruction and Visualization from a Single Projection (ReViSP). [Laurea], Università di Bologna, Corso di Studio in Ingegneria e scienze informatiche [L-DM270] - Cesena
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Abstract

Il volume è una delle feature più importanti per la caratterizzazione di un tumore su scala macroscopica. Viene spesso utilizzato per valutare l'efficacia dei trattamenti assistenziali, rendendo così la sua corretta valutazione una questione cruciale per la cura del paziente. Allo stesso modo, il volume è una caratteristica fondamentale anche su una scala microscopica ma, ad esempio in letteratura, esistono pochissimi metodi proposti per stimare il volume di sferoidi tumorali, modelli tumorali 3D di circa 1 mm di diametro, creati in vitro e ampiamente utilizzati in studi pre-clinici per testare gli effetti dei farmaci e trattamenti radioterapici. Tra i metodi proposti per stimare il volume degli sferoidi tumorali, il più utilizzato è conosciuto con il nome di Reconstruction and Visualization from a Single Projection (ReViSP). E’ un metodo automatico concepito per ricostruire la superficie 3D e stimare il volume di sferoidi multicellulari utilizzando una semplice proiezione 2D, che ad esempio potrebbe essere un'immagine acquisita con un semplice microscopio ottico a campo largo. Il software ReViSP è distribuito come strumento open source con codice sviluppato in MATLAB. Tuttavia, il codice C++ risulta essere più versatile e, non essendo collegato a licenze di utilizzo, meglio si adatta alla politica di codice distribuito in forma di Open Source. In questo lavoro, utilizzando il MATLAB Coder, la libreria OpenCV e molti altri toolbox e librerie, abbiamo creato una versione ottimizzata di ReViSP in linguaggio C++. Il codice è distribuito come strumento open source e può essere integrato in diversi framework C++ utilizzati in oncologia per la stima di feature radiomiche dei tumori.

Abstract
Tipologia del documento
Tesi di laurea (Laurea)
Autore della tesi
Belloni, Sofia
Relatore della tesi
Correlatore della tesi
Scuola
Corso di studio
Ordinamento Cds
DM270
Parole chiave
Biomedical Imaging,Microscopy,Image Processing,Open Source Code,Oncology
Data di discussione della Tesi
7 Ottobre 2021
URI

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