TDSFT (Two-Dimensional Segmentation Fusion Tool): tool open-source per la fusione di segmentazioni bidimensionali create da differenti anatomopatologi

Il trattamento di un tumore è composto da numerose fasi e attività. Tra queste, sicuramente, la segmentazione della zona malata, ossia la corretta identificazione della sua posizione spaziale, è una tra le più importanti e al tempo stesso complesse e delicate. La difficoltà nel ricavare una segmentazione affidabile deriva dalla mancanza di uno standard per l’individuazione dei bordi e dei tessuti circostanti all’area tumorale. Per questo motivo l’intero processo è affetto da notevole soggettività. Data una immagine rappresentativa del tumore, è possibile che diversi operatori associno ad essa segmentazioni differenti e le diagnosi prodotte potrebbero differire tra loro. Oltretutto, dati sperimentali mostrano che l’analisi della stessa zona da parte dello stesso medico in due momenti temporali distinti può portare alla realizzazione di segmentazioni diverse. Date più segmentazioni relative allo stesso tumore, si potrebbero sfruttare metriche statistiche per determinare la più affidabile, da qui identificata come ground truth. Per fare questo, nel corso del tempo, sono stati sviluppati numerosi algoritmi ma ad oggi, ancora, non esiste un metodo validato. Per questo motivo, la ricerca nel settore è ancora attiva. In questo lavoro, abbiamo sviluppato Two-Dimensional Segmentation Fusion Tool (TDSFT), un tool open-source realizzato per sostenere e aiutare gli specialisti che offre una interfaccia semplice ed estendibile in cui vengono proposti numerosi algoritmi per “mediare” (i.e., elaborare e fondere) molteplici segmentazioni. Inoltre, TDSFT è stato progettato per essere facilmente esteso con nuovi algoritmi grazie ad una apposita interfaccia grafica dedicata alla configurazione di nuovi parametri. TDSFT è scaricabile al seguente link: https://sourceforge.net/p/tdsft.